A Casa Beato Nuno está ligada desde a sua origem à história das Aparições de Fátima.

A Irmã Lúcia relata que em 13 de Outubro de 1917 a Virgem Nossa Senhora terá aparecido em determinada altura com a forma que a identificava com a Senhora do Carmo: "Tinha umas coisas penduradas na mão (escapulário) e parecia-se com a imagem que se venera na freguesia da Fátima".

Em 12 de Junho de 1950, o Rev. P. Geral dos Carmelitas, P. Kiliano Lynch, encontrou-se no Carmelo de Coimbra com a Ir. Lúcia. Nesse encontro ela ter-lhe-á pedido que se fizesse algo em Fátima para reavivar a antiga devoção a Nossa Senhora do Carmo na alma do povo português.

O P. Geral tomou a sério este pedido e meteu ombros à obra. A nova fundação devia ser o centro da devoção carmelita a Maria Santíssima. Em 13 de Março de 1955 o próprio P. Geral presidiu, em Fátima ao lançamento da primeira pedra na qual foi gravado: "Mater Decor Carmeli, grati filii hanc domum B. Nonii tibi dedicant. 13 Martii 1955". Assim se fazia referência ao grande herói nacional, o Santo Condestável, e ao dedicado carmelita que foi Fr. Nuno de Santa Maria.

Em 14 de Agosto de 1957 procedeu-se à inauguração da Casa com um vasto programa. Realizou-se um Congresso Internacional da Ordem Terceira presidido pelo eminente carmelita descalço, Cardeal Adeodato Piazza. Participaram também o Rev. P. Geral, Kiliano Lynch, assim como os Provinciais de toda a Ordem, o Sr. Núncio Apostólico, o Bispo Auxiliar de Leiria, alguns Bispos carmelitas, além de muitos outros confrades carmelita e numerosos Terceiros de todas as partes do mundo.

O edifício destinou-se desde a primeira hora a acolher pessoas e instituições que nele quisessem fazer Retiro. Mas outros encontros da mais diversa índole foram sendo realizados nestas instalações que foram preparadas para acolher nos seus cinco pisos umas 160 pessoas. Além dos quartos tem uma Capela, um salão de reuniões/festas, diversas salas de estar, uma ampla sala de jantar e outras dependências necessárias ao bom acolhimento das pessoas. Com o decorrer dos tempos e o surgir de novas necessidades e melhores condições foi-se remodelando a Casa de modo que, actualmente, dispõe de 135 quartos e outras infraestruturas que permitem acolher à volta de 250 pessoas.